Skip to Main Content

Embase: Van PubMed naar Embase

Deze LibGuide biedt een overzicht van de diverse (zoek)mogelijkheden van de biomedische databank Embase op het Ovid platform.

Stappenplan: PubMed search vertalen naar Embase

Wil je vanuit een PubMed zoekstrategie aanvullend zoeken in Embase? Dit stappenplan helpt je met de vertaling:

  1. Controleer de PubMed zoekstrategie.
      Zie Tab 1. Search controleren (hiernaast in de Box: Toelichting stappenplan)

Het vertalen van een PubMed zoekstrategie naar Embase verschilt voor de MeSH termen en de zoekacties op woord

  1. MeSH termen worden vervangen door corresponderende Emtree termen.
      Zie Tab 2. Van MeSH naar Emtree
  2. Voor zoekacties op woord vervang je de PubMed specifieke veldcodes door de veldcodes voor Embase.
      Zie Tab 3. Zoekacties op woord

TipLange zoekstrategie? Breek je PubMed zoekstrategie eerst op in de verschillende onderdelen (bijv. PICO of DDO) en zet vervolgens per onderdeel apart de MeSH termen en zoekacties op woord om.

  1. Heb je een filter gebruikt in PubMed? In Embase kun je limits gebruiken.
      Pagina: Limits

Belangrijk

Een vertaalde PubMed (of MEDLINE) search kan in Embase veel hogere aantallen opleveren. Dit heeft meerdere oorzaken:

  • Embase neemt in tegenstelling tot PubMed en MEDLINE ook conference abstracts in haar collectie op.
  • Embase kent meer Emtree termen aan artikelen toe.
    Een artikel in Embase heeft gemiddeld zo'n 40 Emtree termen, terwijl een artikel gemiddeld 'slechts' 20 MeSH termen krijgt toegewezen.
    • Levert een Emtree term veel meer én irrelevante resultaten op t.o.v. de MeSH term equivalent?
        Zoek dan op de Emtree term met focus (Zie de pagina: Emtree > Thesaurus).

TipWanneer je de zoekonderdelen apart invoert in Embase en PubMed kun je door de aantallen (resultaten) per zoekonderdeel te vergelijken, snel zien of het verschil met een specifiek zoekonderdeel of zoekterm samenhangt.

Toelichting stappenplan

  • Is de PubMed zoekstrategie voldoende sensitief en specifiek (dwz niet te veel irrelevante of te weinig relevante artikelen)?
      Zie de PubMed LibGuide voor tips.
  • Je kunt de zoekstrategie ook laten peer reviewen door de Medische Bibliotheek.
      Neem contact met ons op via de pagina: Contact & Feedback.

MEDLINE Ovid logoHeb je een MEDLINE (Ovid) search die je wilt vertalen naar Embase?
Je kunt het Stappenplan: PubMed search vertalen naar Embase aanhouden. Omdat Embase dezelfde interface (Ovid) heeft als MEDLINE, gaat het zoeken op dezelfde manier! Onder de tabs in deze box vind je per stap ook extra tips voor MEDLINE gebruikers.

MeSH termen kun je niet één op één vertalen naar relevante Emtree termen, omdat PubMed en Embase elk hun eigen systeem hebben. Zoek daarom voor elk zoekonderdeel de relevante Emtree termen handmatig op.

Zie de pagina: Emtree voor uitleg over het opzoeken van Emtree termen.

BelangrijkLet op de volgende verschillen tussen PubMed en Embase:

  • Een individuele MeSH term kan meerdere Emtree termen als equivalent hebben (en andersom).
    Bijv. PubMed heeft één MeSH term voor blaaskanker (Urinary Bladder Neoplasms[MeSH]). Embase heeft hier meerdere Emtree termen voor: o.a. bladder tumor/, bladder cancer/, bladder carcinoma/.
  • Narrower terms worden in Embase niet automatisch meegenomen.
    Bijv. Als je in PubMed zoekt met Hand[MeSH] worden de onderliggende termen zoals Fingers[MeSH] en Wrist[MeSH] standaard meegenomen. Wanneer je dit niet wilt, dan kun je dit uitzetten. In Embase moet je het juist expliciet aangeven, als je de onderliggende termen mee wilt nemen (vink Explode aan om alle narrower terms mee te nemen).
  • Een Emtree term kan een verschillende onderverdeling van narrower terms hebben dan de MeSH term equivalent.
    Bijv. In PubMed is Wrist[MeSH] een narrower term van Hand[MeSH], terwijl in Embase wrist/ op gelijk niveau staat met hand/ en beide Emtree termen direct onder arm/ vallen.

MEDLINE Ovid logo  Tip voor MEDLINE gebruikers
De MeSH termen in MEDLINE zijn identiek aan de MeSH termen in PubMed. Voor de vertaling van MeSH termen in MEDLINE naar Emtree termen in Embase geldt de bovenstaande uitleg. Het enige verschil is dat narrower terms in Embase net zoals in MEDLINE niet automatisch worden meegenomen.

Wanneer je voor PubMed de zoekacties op woord uitgeschreven hebt, kun je deze makkelijk omzetten naar Embase door de veldcodes te vervangen met de zoek en vervang functie (ctrl + H) in Microsoft Word.
Of een artikel nu in PubMed of Embase staat, de woorden uit de titel en abstract blijven immers hetzelfde.

Zie de pagina: Zoeken op Woord voor meer informatie over de mogelijkheden van Embase.

*In PubMed worden de auteurstrefwoorden automatisch meegenomen met de [tiab] search.
PubMed Embase Te doorzoeken velden
[ti] .ti. titel
[tiab] .ti,ab,kf. titel, abstract en auteurstrefwoorden*
[ot] .kf. auteurstrefwoorden
[tw] .mp. 'breed zoeken'
[tw] (= title, abstract, other abstract, MeSH terms, MeSH subheadings, publication types, substance names, personal name as subject, corporate author, secondary source, comment/correction notes, and other terms)
.mp. (= title, abstract, keyword, original title, heading word, floating subheading word, drug trade name, drug manufacturer, device trade name, device manufacturer, candidate term word)
[all fields] .af. alle velden

MEDLINE Ovid logo  Tip voor MEDLINE gebruikers
Om te zoeken op woord gebruikt Embase dezelfde veldcodes als MEDLINE. Zoekacties op woord in MEDLINE kun je copy-paste overnemen in Embase.

Een overzicht van de Embase veldcodes vind je via de tab Search Fields in Embase (Zie box: Zoekvelden).

Oefening: Vertaal de PubMed of MEDLINE search naar Embase

Oefening Je gaat een review schrijven over de (verslechterde) handfunctie in patiënten met Duchenne spierdystrofie. In PubMed heb je gezocht met de onderstaande zoekstrategie:

( Duchenne Muscular Dystrophy[MeSH] OR Duchenne[tiab] OR DMD[tiab] )
AND
( Forearm[Mesh] OR Hand[Mesh] OR Forearm[tiab] OR Forearms[tiab] OR Wrist[tiab] OR Wrists[tiab] OR Hand[tiab] OR Hands[tiab] OR Finger[tiab] OR Fingers[tiab] OR Thumb[tiab] OR Thumbs[tiab] OR Metacarp*[tiab] )

Je vindt echter te weinig artikelen en besluit om aanvullend te zoeken in Embase.
Hoe vertaal je de PubMed zoekstrategie naar Embase?

Oefening Je gaat een review schrijven over de (verslechterde) handfunctie in patiënten met Duchenne spierdystrofie. In MEDLINE heb je gezocht met de onderstaande zoekstrategie:

( Muscular Dystrophy, Duchenne/ OR (Duchenne OR DMD).ti,ab,kf. )
AND
( Forearm/ OR exp Hand/ OR (Forearm OR Forearms OR Wrist OR Wrists OR Hand OR Hands OR Finger OR Fingers OR Thumb OR Thumbs OR Metacarp*).ti,ab,kf. )

Je vindt echter te weinig artikelen en besluit om aanvullend te zoeken in Embase.
Hoe vertaal je de MEDLINE zoekstrategie naar Embase?

Een Embase zoekstrategie voor dit onderwerp zou kunnen zijn:

( Duchenne muscular dystrophy/ OR (Duchenne OR DMD).ti,ab,kf. )
AND
( forearm/ OR exp hand/ OR wrist/ OR (Forearm OR Forearms OR Wrist OR Wrists OR Hand OR Hands OR Finger OR Fingers OR Thumb OR Thumbs OR Metacarp*).ti,ab,kf. )

Uitleg In PubMed (en MEDLINE) is Wrist[MeSH] een narrower term van Hand[MeSH] en wordt deze automatisch meegenomen als je op Hand[MeSH] zoekt (of exp Hand/ in MEDLINE). In Embase is Emtree term wrist/ geen narrower term van hand/, maar van arm/ en moet je wrist/ dus toevoegen.