Skip to Main Content

PubMed: Zoeken op Woord

Deze LibGuide biedt een overzicht van de diverse (zoek)mogelijkheden van het biomedische zoeksysteem PubMed.

Zoekvelden

In PubMed kun je de bibliografische gegevens (auteur, titel, jaar, tijdschrift etc.) van artikelen doorzoeken op woorden. Wanneer je de zoekterm intypt gevolgd door de veldcode, zoekt PubMed in het aangegeven veld naar de opgegeven zoekterm.

Vergelijk het aantal resultaten van de volgende zoekacties (klik op de onderstaande links):

  • Zoeken op het woord diabetes in de titel
diabetes[ti]
  • Zoeken op het woord diabetes in de titel of abstract
diabetes[tiab]
  • Zoeken op de MeSH diabetes mellitus
diabetes mellitus[mesh]

In PubMed wordt niet de volledige tekst van een artikel opgenomen, maar alleen het abstract. Het is dan ook niet mogelijk om het hele artikel te doorzoeken op woorden.

Naast de MeSH zijn de velden: titel en abstract de inhoudelijke velden die vertellen waar een artikel over gaat.

Alléén zoeken op woord is niet genoeg, waarom?

Vaak zijn er verschillen in hoe een begrip omschreven wordt door de auteurs en de zoekers van literatuur. Wanneer je alleen zoekt met de veldcode [tiab], heb je altijd kans dat je artikelen mist.

Vergelijk de aantallen van de volgende zoekacties (klik op de onderstaande links):

In het laatste voorbeeld zie je dat er ruim 65.000 artikelen zijn met de MeSH quality of life, maar waar de frase quality of life niet voorkomt in de titel of abstract. Onder deze 65.000 artikelen kunnen relevante artikelen zitten die je mist als je alleen met de veldcode [tiab] zoekt.

Alternatieve omschrijvingen

Wanneer je zoekt naar woorden die voorkomen in de titel, abstract of als auteurstrefwoord, is het van belang dat je de verschillende omschrijvingen van het begrip meeneemt in je zoekacties. Denk hierbij aan synoniemen, enkel- en meervoudsvormen, Britse spelling, Amerikaanse spelling etc.

Tip1) Is er een MeSH voor het onderwerp? Dan kun je bij de entry terms (Zie tab: MeSH) vaak suggesties opdoen voor synoniemen en deze gebruiken in je [tiab] search.
2) Of voer een simpele zoekactie uit en bekijk de Search Details (Zie tab: Introductie) voor synoniemen waar PubMed op zoekt .

Zoekopties

Frase
Wanneer je in PubMed naar een frase wilt zoeken (woorden staan in precies deze volgorde), kun je aanhalingstekens ("...") gebruiken. Bij het gebruik van aanhalingstekens wordt de automatic term mapping functie van PubMed uitgeschakeld.
Ook wanneer je een veldcode gebruikt, wordt de zoekterm door PubMed gelezen als een frase.

Let op de aantallen en Search details (klik hiervoor op onderstaande links) van deze zoekacties:

Proximity search

Met een proximity search kan je op meerdere termen in context zoeken, waarbij de volgorde van de woorden niet uit maakt. Om een proximity search uit te voeren, werk je in PubMed met het volgende format: “term1 term2”[field:~N]. Op de plek van de N geef je aan hoe ver de woorden maximaal uit elkaar mogen liggen. Met “diabetes complications”[tiab:~3] vind je onder andere  diabetes complications, diabetes-related complications, complications in diabetes

BelangrijkProximity searches kunnen niet gecombineerd worden met wildcards. Denk aan de verschillende woordvariaties, zoals meervoud en enkelvoud, bij het gebruik van proximity searches.

Wildcards
Met een asterisk (*) kun je zoeken op woordvariaties. Als je een asterisk aan het eind van een woordstam toevoegt, zoekt PubMed zoekt op woorden die beginnen met de woordstam aangevuld met 0 tot een oneindig aantal tekens. Als je zoekt op microscop*, zoek je ook op microscope, microscopes, microscopy.

Bij een wildcard search kan de asterisk op verschillende plekken in het woord worden geplaatst. Er kunnen meerdere wildcards in één term worden gebruikt. Als je zoekt op “spin* injur*” zoek je op spine injury, spine injuries, spine injury en spinal injury. Ook in een woord kun je wildcards gebruiken om naar woordvariaties te zoeken, als je zoekt op “tumo*r*” zoek op zowel tumor en tumors als tumour en tumours.

Belangrijk Het gebruik van wildcards kan onnodige ruis creëren, bijv. wanneer de woordstam niet goed gekozen is, of als er ongewenste woordvariaties meegenomen worden.De woordstam moet minimaal vier tekens bevatten, dus geen cel* of pre*.
Voorbeeld: Als je diet* gebruikt om variaties zoals diets en dieting te vinden, wees dan bewust dat je ook zoekt op diethyl ether (een anestheticum) en alle andere stoffen die beginnen met diethyl..
Liever specifieker zoeken? Pas indien mogelijk de woordstam aan of schrijf de relevante woordvariaties uit.